1、实验室应选择在清洁安静的场所，远离生活区，锅炉房与交通要道；
2、实验室应选择在光线充足，通风良好的场所，要与生产加工车间有一定距离；
3、实验室应选择在方便扦样与检验，距离车间较近的工作场所。
根据生产实际需要，一般工厂应设置细菌与理化检验兼有的综合实验室，主要包括以下三大部分：细菌实验室、理化实验室、办公室。
1、办公室
2、理化分析实验室：（或者和细菌检验操作室合并）①理化分析实验室（兼作感官检验室）②仪器室（兼放细菌室显微镜等少量仪器）
3、细菌实验室：①细菌检验操作室②无菌室③培养基制作室④洗涤消毒室
实验室设备及装备配置要求：
食品检验检测实验室可根据生产的产品品种、检测项目的多少和生产规模的大小设置，实验室设备及装备也可繁、可简。
食品检验可分为两大项，一是检测产品的品质项目；二是检测产品的卫生项目，这一类项目的检测相对难度大、投资高。
一、食品检验检测实验室品质项目筹建
品质项目包括水分、含盐量、含糖量、蛋白含量、脂肪含量、纤维含量、维生素含量、酸度等。对于这些项目的检测，如果经费有限，都可以采用化学法分析，只需配置***简单的烘箱。水浴、电炉、搅拌器、粉碎机、PH计等设备即可。如果经费充足或检验批次较多，对应的检测项目都有对应的专用仪器可供选购。此外，也有一些通用的仪器可供选择，如：紫外/可见分光光度计、近红外分析仪、自动滴定仪等。检测维生素A、E等有时还需要配置荧光光度计。检测营养元素，如钙、锌、铁等，可购置原子吸收仪-火焰检测器。
二、食品检验检测实验室卫生项目筹建
卫生项目包括微生物、添加剂、有害元素、农残留、、兽残留、******等。对于一般食品企业，微生物检测实验室应该建。
1、微生物：建微生物实验室要按照生物实验室设备及装备规范标准要求进行布局。必要的设备有洁净台、培养箱、高压灭菌锅、电炉等，其他设备则根据具体检测项目配置。经费少可以买国产的，经费多可以考虑买进口的，两者的价钱相差很多。
2、添加剂和有害元素：有一部分项目可以用化学法，如亚******盐、二氧化硫、重金属含量、总***等。但要想满足现在国标的食品卫生要求，应该购置气相色谱-氢火焰检测器、液相色谱-紫外/可见光检测器，这样一般的防腐防腐剂（苯甲酸、山梨酸等）、甜味剂（甜蜜素、糖精钠等）、色素（柠檬黄、胭脂红等）都可以检测了。购置原子吸收仪-石墨炉检测器，可以分别检测铅、铬、镉、铜、镍等有害元素，还需要一台原子荧光仪，用来检测***和***等。
3、残留农药：检测残留农药气相色谱是不能少的。检测有机氯农药，需配电子俘获ECD检测器；检测有机磷农药，需配火焰光度FPD检测器或氮磷NPD检测器。现在农残检测的项目越来越多，为提高通用性，建议配置毛细管色谱柱。与传统填充柱色谱柱相比，毛细管柱分析项目多，分离度好，可以减少频繁的更换色谱柱，提高分析效率。出口食品加工企业生产的产品在出口时需检测的农残项目越来越多，为了把好生产原料和产品质量关，，可以配置气象色谱-质谱仪。一般只需要配置电子轰击EI源，如果有必要可再配一个负化学NCI源，是选择四极质谱还是离子阱质谱，个人认为都可以，两种仪器各有优缺点。还要看具体工作。
4、残留兽药：若进行残留兽药的检测，项目不多且批次多，可以考虑配置酶联免疫仪，该仪器一次投入不大，操作简便，检测灵敏度高。采用ELISA也有一些缺点，一是试剂盒为长期的消耗品，若检测的批次少成本会比较高，二是特异性不好，可能会有假阳性，三是如果在相对长的一段时间内检测项目较多，成本甚至比仪器分析还高。对于有一定规模的出口食品企业，为适应当前欧盟、美国、日本等发达国家检测限量要求，***好配置一台液相色谱-串联质谱仪。第一台仪器建议配置三重四极质谱仪，灵敏度高，重现性好。仪器不一定要追求高配置，够用就行，但灵敏度、稳定性、抗污染等性能要好。***好买用户较多的型号，有一个与自己检测项目相近的用户群，首先说明该型号仪器检测拟检的项目没有问题，其次也便于今后技术交流。
